24.09.08 Deciphering how early life adiposity influences breast cancer risk using Mendelian randomization. Commun Biol (2022)

https://doi.org/10.1038/s42003-022-03272-5

 

 

mendelian randomization을 사용한 mediation 분석을 어떻게 하는지 파악하기 위해 읽음

 

논문 요약 

 

아동기 비만은 나이 들어서 유방암 위험도에 영향을 주는데 이 논문은 mendelian randomization(MR) 방법을 사용해 둘 사이의 mediator를 찾는다.  Mediator 가능성이 있는 18개 tait에 대해 two-step MR 분석을 해서 아동기 BMI가 이 trait들에 영향을 주는지, 그리고 이어서 이 trait들이 유방암 위험도에 영향을 주는지를 알아보았다. 이어서 multivariable mendelian randomization 분석을 해서 이 trait들을 고려하면 아동기 BMI -> 유방암 간의 mendelian randomization 분석 결과에 변화가 있는지를 봤다. 둘 간의 관계에 영향이 있다고 나온 trait들에 대해서는 mediation 분석을 해서 BMI가 이 trait을 통해서 유방암에 영향을 주는 indirect effect를 측정했다.  

 

 

흥미로운 점

Mediation 분석을 어떻게 했는지 자세히 보면 좋을 것 같아서 이 논문을 읽었다. 

일단, MVMR 결과 BMI -> 유방암 간의 관계에 영향을 준다고 나온 trait에 대해서만 이 분석을 했다는 점이 흥미롭다. 

MVMR을 통해서 이 trait에 mediator로써 역할을 하는지 먼저 판단하고 이 분석으로는 그 effect size를 측정하려고 한 것 같다.  

Next, we carried out a mediation analysis to estimate the indirect effect of childhood body size on breast cancer risk via selected mediators, using the effect estimates from two-step MR, MVMR, and the total effect (Fig. 2b(i), Supplementary Data 6). This analysis was restricted to mediators that showed evidence of an effect in MVMR and that had substantial instrument strength (Supplementary Note 1).

 

다음 부분도 흥미로운데, 어떤 simulation study를 해서 여러 mediation 분석 방법들을 비교했다. 

main 분석에는 product method를 사용했고, SE/CI 계산에는 delta method를 사용했다. 이 접근법은 내 데이터에도 적용할 수 있는지는 더 알아봐야 겠다. 그리고 product method와 delta method의 관계를 더 자세히, 가능하다면 직관적으로 알고 싶은데 이 부분이 더 생각해봐야겠다. 

Using a simulation analysis to compare available mediation methods (Supplementary Note 5), the Product method was chosen with reasonably high confidence as the main mediation analysis approach, with the Delta method as the corresponding SE/CI estimation technique. The indirect effect results are displayed in Fig. 5 and the estimates are available in Supplementary Data 18.